При Горском  ГАУ в соответствии с приказом Минобразования от 21.02.1995 г. №250 открыта докторантура по научным специальностям:
06.02.08   «Кормопроизводство, кормление сельскохозяйственных животных и технология кормов»
06.02.10   «Частная зоотехния, технология производства продуктов животноводства».
В докторантуру принимаются лица, имеющие степень кандидата наук  и задел в научных  исследованиях не менее 70 %. 
Подготовка докторантов осуществляется по очной форме.
Численность докторантов – 2 человека, в том числе 1 докторант проходит подготовку на бюджете. Докторантам, зачисленным в счёт контрольных цифр приёма, выплачиваются государственные стипендии.
За докторантами сохраняются все права по месту работы, которые  они имели до поступления  в докторантуру, а также право на возвращение на прежнее место работы.
Срок подготовки докторантов не должен превышать трёх лет.
Подготовка докторских диссертаций по указанным выше научным специальностям может осуществляться в форме соискательства.
Соискателями учёной степени доктора наук могут являться лица, имеющие учёную степень кандидата наук.
Прикрепление соискателей для подготовки  докторской диссертации производится на договорной основе на срок не более 4-х  лет.
В Горском ГАУ функционируют 5  докторских диссертационных совета по научным специальностям: